Wednesday, July 6, 2022

Descifran la primera secuencia genética de SARS-CoV-2 en el Valle

Valle
Montaje, foto tomada de: Agencia de noticias UNAL.

La secuencia Cali-01, se obtuvo gracias a una estrecha colaboración entre investigadores de la Universidad del Valle, el Centro Internacional de Agricultura Tropical (CIAT) y la Universidad Nacional de Colombia (UNAL) Sede Palmira.

Esta secuencia corresponde al genoma del nuevo coronavirus de uno de los pactaientes contagiados en la capital del Valle del Cauca.

Hasta hace dos semanas en el país solo se contaba con dos secuencias del virus identificadas –una para Bogotá y otra para Antioquia, pero ante el crecimiento del número de casos de contagio en el Valle, los investigadores de estas tres instituciones de la región vieron la necesidad de generar una secuencia que les permitiera saber cómo era específicamente uno de los genomas que circula en el departamento y en su capital.

Diana López, profesora que formó parte del equipo de investigadores dijo que “la Cali-01, publicada el 15 de mayo, es la primera secuencia que se identifica en esta región del país y es punto de partida para entender mejor la transmisión de la enfermedad”.

La docente se refirió a la importancia de adelantar estos estudios, explicando que “si se logra secuenciar distintos genomas podrían compararlos con los más de 27.000 que ya están disponibles en todo el mundo”.

Lo cual permitiría saber, por ejemplo, qué tan parecido es ese aislado con otras muestras, dónde se están presentando las mutaciones, si hay mutaciones únicas para Sudamérica o para Colombia.

La secuencia Cali-01 se consiguió gracias a que la Universidad del Valle es una de las instituciones que está realizando diagnósticos de COVID-19 en el departamento, en el Laboratorio de Microbiología de la Facultad de Salud.

Fue con una de las muestras identificadas como positiva que se invitó a los investigadores del CIAT y de la UNAL a participar en el proceso de secuenciación, gestionando recursos para conseguir los reactivos necesarios para el procedimiento.

Otros estudios 

La idea a partir de la Cali-01 es adelantar otras investigaciones que permitan, por ejemplo en el caso de Cali, entender qué tanto se parece a otras 4 secuencias que se han publicado después para la ciudad.

Todo esto con el fin de identificar si hay mutaciones únicas y si se comparten algunas con las otras reportadas en el país, respecto al genoma de referencia, que es Wuhan-01.

Sin embargo, los investigadores advierten que aún es muy pronto para llegar a conclusiones sobre cómo se comporta la transmisión del virus en la región y en el país, pues para hacerlo se deben evaluar muchas más secuencias en Colombia y en Cali.

Por último la profesora López también comento que la idea es continuar secuenciado más genomas del nuevo coronavirus para el Valle del Cauca, pero por ahora están esperando nuevos reactivos y consiguiendo más dinero para comprar insumos con los que puedan llevar a cabo esta investigación.

Actualmente en el país se siguen realizando esfuerzos por gestionar la pandemia de COVID-19 con medidas como el seguimiento a casos importados y sus contactos que ya suman más de 5 mil, aislamiento preventivo obligatorio de viajeros y casos positivos.

Además, las medidas de distanciamiento social permanente como la prohibición de eventos masivos, la cancelación de clases, el confinamiento de personas mayores de 70 años y el aislamiento preventivo obligatorio en todo el país el cual esta decretado hasta el 31 de mayo.

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